孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，属于永嘉南渡后的世族。孙恩的叔父孙泰是杜子恭的弟子，后来继承了杜子的道法，并受到朝廷官员如孔道、桓放之、周勰等人的敬仰。
在王恭之乱爆发时，孙泰计划以讨伐王恭为名私下起事，但被司马道子父子诱杀。孙恩逃到海岛，聚集了一百多名信徒，以复仇为目的。隆安三年，他率领这群人攻克上虞，并成功破坏会稽郡，杀死了会稽内史王凝之。
随着民心激动不已，“旬日之间”有十万多人响应他的号召。孙恩建立起自己的政权，在会稽地区称自己为“征东将军”，设立官职，并让追随者称自己为“长生人”。他向东晋朝廷提出诛杀会稽王和谢元显父子的要求，但遭到了拒绝。
为了镇压这次叛乱，东晋政府派遣谢琰率领重兵前去讨伐。在这场战斗中，有妇女为了避免被俘，将婴儿装入囊袋投入水中，而告诉孩子们：“贺汝先登仙堂，我寻后就汝。”最终，这场战役导致了许多民众死亡，以及对五斗米道信仰的普遍蔓延。
在接下来的几年里，一系列战斗不断发生，其中包括一次规模庞大的北伐，最终在411年失败。此外，通过这些事件，也促使了冠谦之、陆修静等人的改革，以及南北天师道的兴起。《隋书·经籍志》记载有关于孙恩的一部作品《孙恩集》，但现已佚失。
