孙恩（？～402），东晋五斗米道道士与起义军领袖，字灵秀。出生于琅琊（今山东胶南县境南），家世奉五斗米道，是永嘉南渡后世族之一。其叔父孙泰受杜子恭为师，继承其道法，被人敬信。东晋官员孔、桓、周等都尊敬孙泰。
在王恭之乱爆发时，孙泰以讨伐王恭为名私自聚众准备起事，但被司马道子父子诱杀。孙恩逃往海岛，与数百名信徒相聚，誓死复仇。在民心骚动的背景下，孙恩率众攻克上虞、破会稽，并杀害内史王凝之。此举激发了八郡人民响应，使得会稽八郡沦陷。
孙恩自称“征东将军”，建立官职，并号称“长生人”。他请求诛杀会稽王道子和元显父子，但遭到东晋政府拒绝。在这场动荡中，有妇女为了避难，将婴儿装入囊簏投水，以告别为前提。
谢琰率重兵讨伐孟获，最终击败并杀害许允之等头领。随后，他进兵吴兴，并与刘牢之联手向钱塘江推进。当孟获看到官军即将渡江，便率男女二十余万口撤退至海岛。
在隆安四五年间，一系列战斗继续进行，其中一度逼近建康并攻破广陵。但由于给养困难和疫病流行，“死者大半”。最终，在元兴元年三月，孟获带领部队再次失败，最终选择自沉身亡，其信徒认为他成为了“水仙”，而许多人也跟随他们主人的身去同归于尽。
孟獲與他的門徒崇拜長生久視的神話，以及對天地水三官的信仰，是東晉末年的社會動盪與文化變遷中的重要反映。他所領導的五斗米教運動，也引發了陸修静等人的改革，並促成了南北朝時期天師道的興起。而《隋書》記載有《孟獲集》五卷，但已經失傳。