孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，经历了永嘉南渡。他的叔父孙泰受杜子恭为师后，继承了其道法，并受到许多人的尊敬。黄门郎孔道、鄱阳太守桓放之、骠骑谘议周勰等都曾侍奉孙泰。
当王恭之乱爆发时，孙泰利用讨伐王恭为名，私下聚集徒众准备起事，但在司马道子父子的诡计下被捕并杀害。孙恩逃到海岛，与百余人共同誓死复仇。在民心涣散的局势中，他趁机率领群众攻占上虞、会稽，并杀死会稽内史和五斗米道徒王凝之。这次行动迅速得到八郡人民的响应，有十万人加入他的起义军。
随着力量壮大，孙恩自称“征东将军”，建立官职，将追随者称作“长生人”。他上表要求诛杀会稽王世子与扬州刺史，但遭到了东晋政府的镇压。当谢琰率重兵讨伐时，起义军虽然有所退缩，但仍旧坚持战斗，最终在隆安四年逝世，被信徒认为成为了水仙。
此事件不仅影响了当时社会秩序，也促使了一系列对道教信仰和组织结构进行改革的情况发生。此外，它也预示着南北朝时期天师道的兴起。《隋书·经籍志》记载了孙恩编著的一部作品《孙恩集》，但已失传。