孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖，其字为灵秀，祖籍琅琊（今山东省胶南县境内）。家族世代奉行五斗米道，是永嘉南渡后的一支重要世族。孙恩的叔父孙泰，曾师从吴郡钱塘五斗米道首领杜子恭，并继承了其宗教法门，被人们尊敬。
在东晋隆安二年（398年），王恭之乱爆发时，孙泰以讨伐王恭为名，但实际上是图谋政变。然而，他被司马道子父子诱杀，以及他六子的同归于尽，使得孙恩逃往海岛。在那里，他聚集了一批信徒，准备复仇。
随着民心骚动和社会不稳定的局势发展，孙恩趁机率军攻克上虞、破会稽，并杀死了会稽内史及五斗米道徒王凝之。这一胜利激起了周围八个郡人民的大规模响应，他们纷纷加入到他的起义中。最终，孙恩控制了这八个郡，并自称“征东将军”，建立自己的官职体系，并号称其追随者为“长生人”。
为了剿灭这个威胁巨大的反叛力量，大量重兵被派遣来镇压。他对抗的战争持续到了隆安四年至元兴元年间，在此期间，他不断与朝廷军队交战，最终在元兴元年的三月时因战败而自沉海中，从而成为众多信徒眼中的“水仙”。他的信仰深植于五斗米道对天、地、水三官的崇拜，以及相信长生久视之术。
值得注意的是，这场由五斗米道所引发的起义不仅影响了当时政治格局，也促进了后来的冠谦之等人物对神仙丹药学说进行改革，同时也加速了南北天师道的形成。此外，《隋书·经籍志》记载有《孙恩集》共计五卷，但已遗失无存。
