孙恩（？～402），东晋五斗米道道士与起义军领袖，字灵秀。出生于琅琊（今山东胶南县境南），家世奉五斗米道，是永嘉南渡后的一支世族。其叔父孙泰受杜子恭为师，继承了他的道法，被人尊敬。东晋时期的官员如孔道、桓放之、周勰等都对孙泰表示敬意。在王恭之乱爆发后，孙泰以讨伐王恭为名私自聚集数千人准备起义，但在被诱杀前未能行动起来。
随后，孙恩逃往海岛，并在那里收集了一百多名信徒，以复仇为目的。他在隆安三年趁着民心不稳的机会，从海岛攻占上虞，再破会稽杀死会稽内史王凝之和五斗米道弟子王凝之。这次攻势迅速得到了八郡人民的响应，“旬日之间众数十万”，并且占领了会稽八郡。孙恩自称“征东将军”，设立官职，将自己信徒称为“长生人”，向朝廷提出诛杀会稽王道子和元显父子的请求。
然而，这场动荡引发了更多的叛乱和混乱，在内外戒严的情况下，一些潜伏在建康的人开始行动起来。此时，谢琰率重兵前往镇压，并成功击败了许多起义军头目，最终迫使孙恩退入海岛。在此之后，他继续领导残余部队进行战斗，最终在402年三月自沉 海中，其信徒则认为他已成为了“水仙”。尽管如此，此次起义对当时社会产生了深远影响，为后来的宗教改革和天师派运动奠定了基础，而关于他的著作《孙恩集》也被收入《隋书·经籍志》中，但遗失无存。
