在明清时期，道教医学经历了蓬勃发展，其特点体现在与医学的密切结合上，以及许多医家兼具道术与医术。自明代起，道教医学的精髓被融入中医理论和临床实践中，这促进了传统医学理论的创新和养生学的繁荣。其中，命门理论、心肾相交论以及奇经八脉论成为了养生与临床指导思想。
明代著名的是一些将道教医学思想融入医疗实践的人物，如李时珍在编撰《本草纲目》时参考了大量道教文献，其对本草学产生了深远影响。此外，《滇南本草》，由兰茂所编辑，也展示了道教医学对本草学贡献的一面。兰茂不仅精通医药，还涉猎内丹养生、文学、戏曲、绘画等多个领域。
《滇南本草》是一部保存最为完整的地方性本草书籍，它详细记录了云南省当地各类植物及其应用。在后世，有如吴其浚等植物学家也引用此书中的资料。同时，孙一奎等人受到了道教影响，他们在基础理论上作出了重要贡献，如孙一奎提出的命门——肾间动气论，对后世有着重要意义。
除了这些例子之外，还有其他多位医家如周慎斋、傅青主和祝登元，他们各自创造了一些新的治疗方法和理论，使得传统中医疗法更加丰富多彩。随着时间的推移，道教医学逐渐成为传统中医疗法的一个不可或缺组成部分，为人们提供了一种独特而全面的健康维护方式。