在明清时期，道教医学蓬勃发展，其特点主要体现在与医学的深入融合以及对中医理论和临床实践的重要贡献。道教医家不仅精通道术，还擅长医学，他们将道教的养生学和内丹炼法引入到传统医学中，对于本草学、命门理论、心肾相交等方面都有着深刻影响。
李时珍在编撰《本草纲目》时，就参考了大量道教医学著作，这一举措反映出明代本草学与道教医学之间密切的联系。兰茂所编辑的地方性本草《滇南本草》，也是这一点的一个典型例证。这部书籍内容丰富，保存完整，是我国古代地方性本草学专书中的佳作。
孙一奎是另一个代表性的例子，他受到了罗浮道人的指导，将道家的修炼理念应用于医学领域。他认为习医者需要参考“道理”，并将其医书命名为《赤水玄珠》，体现了他对仙丹秘方和炼制方法的研究兴趣。此外，他还系统阐述了命门——肾间动气论，为后来的命门学说做出了早期准备。
此外，还有周慎斋、傅青主、祝登元等其他医家，他们各自也有自己的理论贡献，如周慎斋提出的心肾相交论；傅青主对妇科学临床具有重要影响；祝登元则直接将内丹炼养作为治疗的心法。
总之，在明清时代，虽然经历了多次变革，但 道教与医疗之间紧密结合，并且推动了传统中医疗疗理论和实践的创新。这些成就至今仍对现代中国药物研究产生影响。
