在明清时期，道教医学得到了蓬勃发展，其特点主要体现在与医学的密切联系上，以及许多道士兼具医术。自明朝开始，道教医学的精髓被吸收进了中医理论和临床实践之中，这促进了传统医学理论的创新和养生学的繁荣。此期间，最显著的成就包括命门理论、心肾相交论体系，以及奇经八脉论成为养生与临床医疗指导思想。
明代见证了一系列融合道教医学思想的大师，他们在本草学方面产生了巨大影响。李时珍编写《本草纲目》时大量引用晋代以来的道教医学著作，他所引用的书籍总共有440种，其中包含40多种关于道家的文献。顾景星赞颂李时珍：“其以神仙自命，岂偶然哉！”
兰茂是另一位对本草学有重大贡献的人物。他编辑了《滇南本草》，这部作品展示了道家对药材研究的深远影响。兰茂出身于云南省，他研习医药始于母亲病痛之际，从此致力于探索药材原理及古人智慧，一直坚持三十余年。在他的方剂治疗中，不仅精通医技，还涉猎内丹养生、文学、戏曲绘画以及地理知识，对这些领域都有着丰富的著述。
《滇南本草》是一部保存最为完整且内容最为丰富的地方性本草学专著，它不仅提供了一种地方文化视角，更是研究古代药材宝库的一个重要资源。清代植物学家吴其浚在其名作《植物名实图考》、《植物名实图考长编》中引用了该书中的70条资料。
此外，孙一奎也代表了一群受道家影响较深的大夫。他撰写了两部重要医疗著作：《赤水玄珠》、《医旨绪余》，并出版了一系列诊疗案例。这两部作品对于后世传统医疗理论具有重要价值。而孙一奎将“庄子·天地”中的寓言故事用于命名他的一些论文，如他认为了解“仙法”能助理解决疾病问题，因此他常借用这种方法来解释他的治疗方案。
周慎斋提出心肾相交论，而傅青主则专注于妇科疾病，并撰写了有关这一领域的话题祝登元则通过内丹炼养来解决心因性疾病。在这个时代里，尽管存在一些分歧，但总体而言，各派皆致力于整合传统知识，为现代社会带来了积极改变。
随着时间推移，这些来自不同方向但共同追求健康与生命延续目标的人们，将他们各自擅长的手艺汇集起来，为后世留下宝贵遗产，即便是在当今世界，我们仍能从他们那里的智慧和经验中学到很多东西。
