近年来，人们常提问：美国信教人众多为何科学发展迅速，而中国无神论主导却未能孕育出世界顶尖的科学家？笔者认为，这个问题并不简单。宗教与无神论并非决定科学进步的关键因素，而是思想解放和学术自由构成了科学繁荣的根本保障。有人把科学与无神论等同视作一对天然盟友，但实际上，情况远不止如此。
有位美国顶尖科研人员指出，他所在领域中大约有一半的人持有宗教信仰，一半则不信。笔者询问他是否在研究时会遇到内心冲突，他坦言：“有时候会，有时候不会。”他们将实证方法应用于工作日的科研活动，与周末礼拜纯净心灵相分离。不过，当发现与某些宗教教义或伦理相悖时，他们也会感到困惑。这时，神学便发挥作用，它探讨了信仰、伦理与知识之间的关系。在西方历史上曾经出现过宗教与科学对立的情况，但随着文艺复兴、宗教改革以及启蒙运动，现在社会已建立起政教分离和保障学术自由的体制，使得各国能够更好地协调宗教与科学。
然而，即使以无神论为主导意识形态的国家是否必定推动科技进步也是一个复杂的问题。苏联曾经因为思想封闭而导致遗传学落后于其他国家。而且，对于大学设立宗教学专业进行严谨研究，也对于全面理解人类思想史和文化至关重要，即使批判它，也要基于深入了解。
启蒙理性的批判性角色在推动西方从中世纪向现代转变过程中扮演了关键角色，为近代科技发展奠定了基础。但同时，我们也应反思启蒙理性在批判宗教时是否忽略了道德维度，以及如何从这些古老文化中汲取能促进道德培养的一般原则，以此促进社会更加和谐共处。