政府与科学界的分歧
在20世纪末，随着现代科学技术的迅猛发展，西医对人体健康状况有了更深入的理解。然而，气功作为一种传统文化实践，其效用与现代医学标准相去甚远，这导致政府和科学界开始质疑气功是否真正具有治疗作用。政府面临的是如何平衡传统文化与现代化进程的问题，同时也要考虑到公众健康安全问题。
气功中的欺诈行为
伴随着气功流行的一种现象是各种各样的骗子出现，他们通过宣扬无效或虚假的疗法吸引民众投钱投资或者购买不切实际的产品。这类行为严重损害了民众信任，并且给社会治安带来了负面影响。政府出于维护社会稳定和公民权益，被迫介入并采取措施打击这些欺诈行为。
法律法规上的漏洞
在禁止之前，对于气功等非医学专业领域实践缺乏明确法律框架。这使得一些商业化运作的手段得以滥用，因为没有具体规定其可接受范围和操作规范。此外，由于当时关于医疗服务条例中对于非正规医疗活动未能得到妥善处理，因此无法有效地限制那些声称能够治疗疾病但实际上无任何依据的人士。
公共资源分配问题
国家公共卫生资源有限，而许多地方为了推广某些特定的气功形式而投入大量资金进行宣传和培训。这就意味着其他可能更加必要、有效率的公共卫生项目被忽视，从而导致整体公共健康服务体系失去了合理性。此外，这也引发了一些争议，即使用税款支持这些“非正式”实践是否合适？
社会舆论压力
随着媒体报道不断曝光多起因练习气功致死或受伤事件，以及一些名义上的“大师”号称拥有超自然能力，但经常性的表演失败、欺骗事件等，一时间社会舆论对此产生了强烈反响。这种负面声音促使政府不得不重新审视这一问题，并最终决定采取行动，以保护公众利益并恢复人们对官方政策的信心。