近年来，人们常提问：美国尽管信教众多，科学却繁荣；中国虽然无神论主导，却未能孕育顶尖科学家。笔者认为，宗教与无神论并非直接决定科学发展的因素，而是思想解放和学术自由为科学进步提供了保障。有人将科学视作无神论的伙伴，但笔者认为问题更复杂。一位美国顶尖科学家指出，他所在领域约有一半人有宗教信仰，一半无，有些人可能会感到内心冲突。但他们通常将实证方法用于工作日，对于周末的宗教活动则保持纯净的心灵。只有当科学与某些教义相冲突时，他们才会有纠结。此时，神学就扮演着调解角色，它探讨信仰、伦理和知识之间的关系。
西方历史上确实存在过宗教与科学对立的情况，那是一种思想禁锢和反对异见的态度。在经历了文艺复兴、宗教改革及启蒙运动后，当今社会建立起政教分离和保护学术自由的制度。这就是为什么欧美等国家，即使信仰较多，也能维持高水平科技发展的一个原因。
是否以无神论为主导的国家必然科技发达，这个问题也难以给出明确答案，因为关键还在于是否实现思想开放和学术自由。苏联曾经由于严格控制学术自由而落后于世界。而研究不同文化中的神学，不仅可以帮助理解人类思想史，还能增进批判性思维能力。
启蒙理性的批判对于中世纪结束至现代转变具有重要意义，它打破了旧有的思想束缚，为现代科技发展奠定基础。不过，在批判过程中，我们应该反思是否忽略了道德层面？人类数千年的宗教传统对于社会伦理至关重要。在追求更加谐和社会时，我们应当从这些传统中学到那些能够培养道德方面成果的事物，以此作为启蒙理性的补充。