孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，属于永嘉南渡后的世族。孙恩的叔父孙泰是杜子恭的弟子，后来继承了杜子的道法，并受到朝廷官员如孔道、桓放之、周勰等人的敬仰。
在王恭之乱爆发时，孙泰计划以讨伐王恭为名私下起事，但被司马道子父子诱杀。孙恩逃到海岛，聚集了一百多名信徒，以复仇为目的。隆安三年，他率领这群人攻克上虞，再破会稽，杀死会稽内史王凝之。这一行动迅速得到八郡人民的大力支持，“旬日之间”有十万多人加入他的队伍。
随着势力的扩大，孙恩自称“征东将军”，建立了自己的政权，并号称其追随者为“长生人”。他向东晋朝廷提出诛杀会稽王道子及其父亲的要求，但遭到了拒绝。面对这一情况，他继续领导起义军与政府部队进行激烈战斗。
尽管如此，由于给养短缺和疫病流行，加上政府加强防御，最终导致了起义失败。在元兴元年三月，当孙恩进攻临海时，他选择自沉海中，而他的信徒们认为他成为了水仙，有数百人跟随他投水身亡。此事件不仅动摇了晋室的统治，还引发了南北朝时期对于天师道的一系列改革和变化，其中包括冠谦之、陆修静等人物对天师教派所做出的贡献。此外，这场反叛还促使人们重新思考宗教与政治间关系的问题，对后来的历史产生了深远影响。