孙恩（？～402），东晋五斗米道道士与起义军领袖，字灵秀。出生于琅琊（今山东胶南县境南），家世奉五斗米道，是永嘉南渡后世族之一。其叔父孙泰受杜子恭为师，继承其道法，被人敬信。东晋官员孔、桓、周等都尊敬孙泰。
在王恭之乱爆发时，孙泰以讨伐王恭为名私自聚众准备起事，但被司马道子父子诱杀及灭门。孙恩逃到海岛，与百余名信徒图复仇。在民心不满的机会下，孙恩率领起义军攻克上虞，再破会稽，并杀害内史王凝之。此举激发了八郡人民响应，使得会稽、吴郡等地的人们加入他的队伍。
随着势力的扩大，孔回称自己为“征东将军”，设立官职，并号称自己的追随者为“长生人”。他向朝廷提出诛杀会稽王和元显父子的要求，但遭到了拒绝。在此背景下，一场规模巨大的反抗运动在浙东地区展开。
然而，在谢琰率领的重兵对抗中，起义军失利并多次撤退，最终在隆安四年三月时因失败而自沉海中，而他的死也被五斗米道信徒认为是成为了水仙，有百余人跟随投水殉葬。卢循成为新任领导人物继续带领残存部队作战，最终未能改变命运，只能求生的途径更加艰难。
作为五斗米道组织者的领导者，孛建立了一个由天、地和水三神组成的崇拜体系，并相信长生久视之术。他通过这种方式挑战了当时的封建统治，同时也促进了北朝时期宗教改革，如冠谦之与陆修静推动的改革，以及南北天师 道系统的出现。而关于他的著作《孙恩集》则已遗失无踪。这段历史对于理解中国古代宗教文化以及社会动荡有着重要意义。
