孙恩（？～402），东晋五斗米道道士与起义军领袖。祖籍琅琊，家族世奉五斗米道，是永嘉南渡后的世族。其叔父孙泰受杜子恭为师后，继承其法术，被人尊敬。在东晋时，有官员如孔道、桓放之、周勰等都敬事孙泰。然而，当王恭的叛乱爆发时，孙泰以讨伐为名私下聚集数千人准备起事，但在司马道子父子的诱捕下被杀害。
孙恩逃往海岛，与百余名信徒立誓复仇。他趁着民心浮动之机，在上虞攻克会稽，并杀死内史王凝之及五斗米道徒王凝之。这次行动迅速得到了八郡人民的响应，他们一日之间聚集了十几万人。随后，孙恩自称“征东将军”，建立官职，并号称自己和追随者为“长生人”。他向朝廷提出诛杀会稽王和元显父子的请求，但遭到拒绝。
面对这一情况，朝廷派遣谢琰率军镇压起义，但他的部队在进攻义兴时遭遇阻力，最终击败了许允之。但当他们推进至乌程并计划过钱塘江时，孙恩率领二十余万男女撤退至海岛。
尽管如此，此次起义仍然给予了深远影响，不仅导致了南北天师道的出现，还促使冠谦之、陆修静等人物对道教进行改革。此外，《隋书·经籍志》中有记载《孙恩集》的存在，但已遗失不存。