孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，且是永嘉南渡后的一支重要世族。他的叔父孙泰曾受吴郡钱塘五斗米道首领杜子恭为师，并继承了其法术，被人们尊敬信任。在东晋时期，有黄门郎孔道、鄱阳太守桓放之、骠骑谘议周勰等人都尊敬孙泰。
在隆安二年（398年），王恭的叛乱爆发，孙泰以讨伐王恭为名私自聚集数千人准备起事，但未能成功，被司马道子父子诱杀。孙恩逃到海岛，收集百余名部下决心复仇。在隆安三年，他趁着民心浮动之机，率军从海岛攻占上虞，并破会稽，将会稽内史王凝之斩杀。此举迅速得到八郡人民的响应，“旬日之间众数十万”。
随后，孙恩建立自己的政权，在会稽称自己为“征东将军”，设立官职，并号称其追随者为“长生人”。他向东晋政府提出诛杀会稽王道子和元显父子的要求，但遭到了拒绝。为了镇压这场起义，谢琰率兵前往对抗，最终击败了许允之等头领。
经过一系列战斗和撤退，最终在元兴元年（402年）三月时失败自尽，被五斗米道徒认为已经成仙投水而死，从而影响了许多信徒。这次起义虽然最终失败，但它不仅动摇了东晋封建统治，还促使了一些高层人物如冠谦之、陆修静对天师 道进行改革，以及南北朝时期天师教派的兴盛。