孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，属于永嘉南渡后的世族。孙恩的叔父孙泰是五斗米道的继承人，被尊为师表。东晋时期，黄门郎孔道、鄱阳太守桓放之、骠骑谘议周勰等都曾敬仰孙泰。
然而，当王恭之乱爆发时，孙泰被误认为要起事反抗朝廷，便被司马道子父子诱杀了。孙恩逃往海岛，与少数信徒秘密聚集，以复仇为目的。在民心不稳定的背景下，他趁机率众攻克上虞，并破坏会稽地区，将会稽内史王凝之击败。此举激励了八郡人民响应，最终占领了会稽八郡。
随后，孙恩自称“征东将军”，建立官职，并号称其追随者为“长生人”。他向朝廷提出诛杀会稽王道子及其父子的要求，但遭到了拒绝。面对谢琰率领的重兵讨伐，他率部退至海岛继续抵抗。
尽管在之后的一系列战斗中孕育了一些胜利，如攻破广陵，但由于给养不足和疫病流行，加上战局逐渐转差，最终在元兴元年（402）三月，由于进攻临海失败而自沉于海中。他的死使得许多信徒相信他已经成为了“水仙”，并投入水中寻找他。
此事件也促使卢循成为新一任领导者，并继续领导着剩余的义军力量。不过，这场起义最终在411年宣告失败。在整个过程中，孙恩以五斗米道组织起义，不仅动摇了当时的封建统治，还引发了南北朝时期对于天师教派改革与发展的大讨论。而关于他的著作《孙恩集》则已失传，只有《隋书·经籍志》记载其存在但已佚失。
