孙恩（？～402），东晋五斗米道道士与起义军领袖，字灵秀。出生于琅琊（今山东胶南县境南），家世奉五斗米道，是永嘉南渡后的一支世族。其叔父孙泰受杜子恭为师，继承了他的法术，被人尊敬。东晋官员孔道、桓放、周勰等都对孙泰有所礼遇。在王恭之乱爆发时，孙泰以讨伐王恭为名私自聚集数千人准备起义，但在司马道子父子的诡计下被捕杀害。孙恩逃往海岛，与几百名信徒组成队伍，以复仇为目的。
隆安三年（398年），会稽王世子司马元显免奴充兵役，引发民心不满。当时的局势让孙恩趁机率军从海岛攻克上虞，再破会稽，将会稽内史及五斗米道徒王凝之击败。这次胜利迅速吸引了八郡人民响应，“旬日之间众数十万”，共同推翻了当地的封建统治。
随后，孙恩自称“征东将军”，设立官职，并号称其信徒为“长生人”。他向朝廷提出诛杀会稽王和元显父子的要求，但遭到拒绝。在此期间，他在各地建立了一系列组织，并且影响到了整个国家的政治局势。
然而，由于内部矛盾和外部压力，最终导致了起义失败。在最后一战中，谢琰率领重兵成功击败了起义军并俘获许允之。一段时间之后，当卢循成为新的领导者时，他继续带领余众反抗，但最终在411年失去了战斗力。此事件不仅动摇了晋室，还促进了一系列宗教改革，如冠谦之、陆修静等人的天师道改革，以及北方天师道的兴盛。
《隋书·经籍志》记载有《孙恩集》五卷，但已散佚。这位传说中的水仙对于许多人来说代表着一种坚持信仰和反抗压迫的象征，而他的故事也深刻影响着中国历史上的宗教变迁。
