孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，且是永嘉南渡后的一支重要家谱。他的叔父孙泰受杜子恭之教，并继承其道法，深受人们敬仰。东晋时期的黄门郎孔道、鄱阳太守桓放之、骠骑谘议周勰等人都曾尊礼孙泰。
然而，在王恭之乱爆发时，孙泰利用讨伐王恭为名私下聚集数千人准备起义，但最终被司马道子父子诱杀。孙恩逃往海岛，与一百余名信徒共同誓死复仇。在民心浮动的机会下，他率领部队攻克上虞并破会稽，杀害了会稽内史及五斗米道弟子的首领王凝之。这次胜利迅速吸引了会稽、吴郡、吴兴、义兴、临海、新安和东阳七郡的人们响应，“旬日之间”众数十万归附他。
随后，孙恩自称“征东将军”，在会稽建立政权，并号称其追随者为“长生人”。他向朝廷提出诛杀会稽王世子和扬州刺史，但遭到拒绝。在此背景下，他与谢琰率领的官军展开激烈对抗，最终在隆安四年十二月被击败。此后，他多次尝试反扑，但因给养不足以及疫病流行而失败，最终在元兴元年三月自沉海中去世。他的信徒认为他成为了水仙，从而投水自尽的人数达到了百余人。
虽然失去了领导者的生命，但是孙恩所带来的影响依然巨大，其组织起来的五斗米道起义不仅动摇了晋室封建统治，还促进了天师 道学派别的发展，以及陆修静等人的改革活动，对后来的南北朝时期宗教文化产生了深远影响。而关于他的事迹，有《隋书·经籍志》记载有《孙恩集》五卷但已散失。