孙恩（？～402），东晋五斗米道的著名道士和起义军领袖。他出生于琅琊（今山东省胶南县境内），家族世代奉行五斗米道，属于永嘉南渡后的世族。孙恩的叔父孙泰是杜子恭的弟子，后来继承了杜子的道法，并受到朝廷官员如孔道、桓放之、周勰等人的敬仰。
在王恭之乱爆发时，孙泰计划以讨伐王恭为名私下起事，但最终被司马道子父子诱杀。孙恩逃到海岛，与数百名信徒聚集，一心复仇。在民心动荡的情况下，孙恩率众攻克上虞、会稽，并杀死会稽内史王凝之。他的起义迅速得到八郡人民的响应，他自称“征东将军”，建立官职，并号称其追随者为“长生人”。
东晋政府派谢琰率兵平叛，最终击败了起义军头领许允之并逼近建康。然而，由于给养短缺和疫病流行，加上东晋加强沿海防御，起义军逐渐衰弱。在元兴元年（402）三月，孙恩在临海战败后选择自沉身亡，其信徒则认为他已经成为了“水仙”。剩余的义军继续由卢循领导，最终在411年被平定。
作为五斗米道的一员，孙恩深信长生久视的教导，以及天地水三官神灵。他通过组织五斗米道成员发动起义，不仅动摇了东晋封建统治，还促使了一系列对晚期中国古代宗教生活影响深远的人物，如冠谦之和陆修静进行改革，同时也推动了南北朝时期天师 道学说的发展。此外，《隋书·经籍志》中有记载《孙恩集》的存在，但已佚失。