宗教与非宗教的本质差异在于其社会功能、崇拜对象、理论学说和活动方式等多个层面。首先，宗教机构通常承担着融入社会、服务社会和维护社会稳定的角色，而某些组织则以反对现有制度为己任，甚至涉及危害性质。其次，正统宗教往往崇拜超越自然界的神明，不允许信徒自称或盲目追随“神人”，而有些团体却会宣称其头领拥有与神相同的权力，从而达到对成员的心灵控制。此外，宗教学说系统化且注重现实生活的安慰，而某些组织则倾向于制造末日恐慌，以此来诱导人们加入并实现所谓“得救”。再者，合法宗教活动遵循一定程序进行，并受到政府监管，而一些秘密社团则采取地下形式进行活动，使得参与者难以脱身。此最后，正当宗教旨在提升精神境界和推动社会进步，而这些秘密社团往往利用欺骗手段满足个人欲望，并企图掌控整个社会秩序。
综上所述，这些区别揭示了不同类型组织之间存在根本性的差异，不同于传统意义上的宗教，它们更像是反体制力量，其行为模式与黑帮相似，有潜在的破坏性影响。