在深入研究马克思主义宗教观的中国化过程中，我们发现了一些值得商榷的观点。这些认识如果不予以澄清，就有可能影响我们对马克思主义宗教理论研究方向和深度的正确理解。
首先，有一种观点认为，“研究宗教必须坚持马克思主义宗教观”。然而，这种说法并不准确，也不科学，因为它违背了马克思主义的基本原理，并且不符合当今社会多元信仰时代的实际需求。真正在实践中进行宗教研究的人们，应该从各种不同的、各具特色的观点中梳理出对宗教问题的一致性认识，同时也要继承和批判历史上以及国内外学者的成果，以构建中国特色马克思主义宗教学的大厦。
其次，还有一种观点认为，“研究宗教同时就必须批判有神论，宣传无神论”。笔者认为，这样的看法是片面的。我们的任务是按照党和人民赋予的使命，不仅要做好历史、理论、现状等方面的研究工作，更重要的是要与信仰者建立友好的关系，了解他们过去与现在的情况，以及他们急需解决的问题和困难，以便通过我们的工作来反映并帮助解决这些问题。
在这一过程中，我们应该树立大局意识和忧患意识。在当前经济社会发展战略机遇期，同时也是社会矛盾凸现期，特别是在利益格局调整加快时，我们需要引导得当，将宗教问题转化为促进社会稳定与和谐的一股力量，而不是成为不安定因素集中地带。
此外，对于那些自称“我们 马克思主义者”的人来说，他们所讲述的话是否符合马克思主义基本原理，要靠实践来检验。这也是我们党长期以来一直反对形式上的“两凡一”——即形式上的“凡事皆可”、“凡事皆应”、“凡事皆非”，而主张实质性的探索创新之路。
最后，我们还需要明确的是，改革开放30多年来，我国各种宗教都经历了长足发展，但这种发展始终保持在正常范围内，没有超出法律允许范围。如果它们没有超出边界，那么就是正常行为，是不会被干预的。在这个信仰多元化的时代，每个人的世界观不同，对同样事情也有不同的看法，所以真正意义上的马克思主義者，就是从这些不同角度中梳理出对于一个问题的一致性认知。而这正是我们今天面临的一个挑战：如何既坚守自己的世界观，又能够尊重他人的选择，从而共同构建一个更加包容、更加文明的地球社区。