宗教与非宗教的本质差异在于其社会功能、崇拜对象、理论学说和活动方式等方面。首先，宗教倡导信徒融入社会，服务社会，并且维护国家的稳定和谐，而非宗教组织则往往会煽动成员对社会产生仇视情绪，并危害社会秩序。此外，宗教中崇拜的是超越自然界的神灵，而非宗教组织中的头目往往自称是“神”的替身或代表，以此来控制成员的心理。
再者，宗教有着自己完整的理论体系和典籍，而非宗教组织则更多依靠恐怖宣传来吸引信徒。他们常常制造末日论断来恐吓人心，这种做法与真正的宗教学说大相径庭。
此外，不同的是，在合法登记的情况下，真实存在并且被政府认可的宗教团体拥有公开举行集体祈祷场所，但反之，则采取秘密活动方式，如黑帮一般，将信徒牢牢束缚在其控制之下。
最后，最根本的问题是：一方面，真实存在的人类行为追求精神上的提升；另一方面，一些个人的野心驱使他们利用人们对未知事物的好奇心，以及人们渴望安宁与安全的心理需求，从而建立起一个充满迷惑性的世界观，为自己的私利服务。